Logiciel comptabilite et TVA pour auto-entrepreneur en 2026

Mis à jour : 2026-06-097 min✓ Vérifié mai 2026

La comptabilite d un auto-entrepreneur est plus simple que celle d une entreprise classique, mais elle reste obligatoire. Un bon logiciel comptable vous aide a tenir votre livre de recettes, calculer vos cotisations URSSAF et gerer la TVA si vous y etes assujetti.

Obligations comptables de l auto-entrepreneur

En tant qu auto-entrepreneur, vous devez tenir un livre chronologique des recettes encaissees. Si vous exercez une activite commerciale, vous devez aussi tenir un registre des achats. Ces documents doivent etre conserves dix ans.

La TVA s applique si votre chiffre d affaires depasse les seuils de franchise : 36 800 euros pour les prestations de services et 91 900 euros pour les activites de vente. En dessous, vous beneficiez de la franchise en base et n avez pas a la collecter.

  • Livre de recettes obligatoire pour toutes les activites
  • Registre des achats obligatoire pour les activites commerciales
  • TVA a partir de certains seuils de CA
  • Conservation des justificatifs pendant dix ans
  • Declaration URSSAF mensuelle ou trimestrielle

Les meilleurs logiciels comptables pour auto-entrepreneurs

Shine est un compte pro avec comptabilite integree, specialement concu pour les independants francais. Il genere automatiquement votre livre de recettes et vous rappelle les echeances URSSAF. Indy (anciennement Georges) propose une comptabilite automatisee avec connexion bancaire et export des documents fiscaux.

Freebe est un logiciel specialise pour les freelances et auto-entrepreneurs qui combine facturation, suivi des depenses et estimation des cotisations en temps reel. QuickBooks propose une version auto-entrepreneur abordable avec gestion de la TVA et connexion aux principales banques francaises.

  • Shine : compte pro plus comptabilite tout en un
  • Indy : automatisation comptable avec connexion bancaire
  • Freebe : specialise freelances avec simulation cotisations
  • QuickBooks AE : version allegee avec gestion TVA

Comment choisir son logiciel comptable

Si vous etes assujetti a la TVA, privilegiez un logiciel qui gere les declarations TVA automatiquement et qui peut exporter au format compatible avec votre expert-comptable. Si vous n y etes pas encore, un outil simple de suivi des recettes suffit.

Verifiez que le logiciel se connecte a votre banque principale et qu il peut generer les documents demandes par l URSSAF. La tarification doit rester proportionnelle a vos besoins : inutile de payer une solution PME quand une version independant suffit.

Comparatif des meilleures solutions

🏆 Notre recommandation

Indy

Version gratuite
4.4/5

0€/mois (Micro) / 26€/mois (Solo)

Points forts

  • Facturation et comptabilité dans un seul outil
  • Prépare automatiquement les déclarations URSSAF
  • Bilan annuel inclus dans le plan Solo
  • Idéal si vous n'avez pas d'expert-comptable

Limites

  • Plan Micro limité à 50 transactions par mois
  • Moins personnalisable que des logiciels spécialisés
  • Prix en hausse récente sur le plan Solo
PDP agréée DGFiPComptabilité intégréeDéclarations URSSAFSynchronisation bancaireBilan annuel
Essayer Indy gratuitement

Lien affilié, sans frais supplémentaires

PDP agréée DGFiP

Tiime

Version gratuite
4.6/5

Gratuit (Essentiel) / 9€/mois (Pro)

Points forts

  • Plan gratuit très complet pour les micro-entrepreneurs
  • Agréée PDP par la DGFiP
  • Interface claire et rapide à prendre en main
  • Synchronisation avec 300+ banques françaises

Limites

  • Fonctions avancées réservées au plan payant
  • Pas d'intégration native avec les outils de CRM
  • Reporting limité sur le plan gratuit
PDP agréée DGFiPFactur-XSynchronisation bancaireExpert-comptableApplication mobile
Essayer Tiime gratuitement

Lien affilié, sans frais supplémentaires

Certains liens sont des liens affiliés. Cela ne change rien au prix que vous payez.

Questions fréquentes